그는 2010년께 분식회계가 적발된 태양광 소재 업체 네오세미테크의 주식을 매도해 1억원 이상 수익을 낸 것으로 밝혀져 미공개 정보 이용 의혹이 불거졌다.
민 특검은 "주식 최득과 매도 담양출장샵 과정에서 위법 사항이 없었다"고 직접 해명했지만 정치권에선 사퇴 요구까지 나왔다.
수사 기간 말미에는 특검이 국민의힘뿐 아니라 민주당 측도 통일교에서 부정한 금품을 받은 정황을 포착했으면서도 제대로 수사하지 않았다는 '편파 수사' 의혹까지 제기됐다.
각종 악재에 대처하느라 상당한 힘을 쓴 특검팀은 결국 일부 굵직한 수사를 마무리하지 못한 채 해산하게 됐다.